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La puce à ADN identifie les mycobactéries (06/02/1999)

BioMérieux a réussi à typer génétiquement des mycobactéries d'intérêt clinique avec le système GeneChip d'Affymetrix.
Les mycobactéries sont responsables de pathologies chez l'homme, notamment la tuberculose. Elles interviennent aussi dans les infections opportunistes chez le sujet immunodéprimé. En particulier au niveau d'atteintes pulmonaires, ostéoarticulaires, cutanées et sous-cutanées, et d'infections généralisées. Souches du VIH résistant aux thérapies Or justement, Biomérieux vient de publier des travaux qui pourraient améliorer le diagnostic des ces infections. En utilisant une puce à ADN, l'équipe d'Alain Troesch a montré qu'il était possible d'identifier simultanément, en quelques heures, l'espèce d'une mycobactérie et son profil de résistance aux antibiotiques. Pour ces travaux, les chercheurs ont utilisé la Gene Chip du californien Affymetrix. Il s'agit d'un support en verre d'environ 1 cm2 sur lequel sont synthétisés in situ des centaines de milliers de sondes oligonucléotides qui, par hybridation, permettent d'identifier rapidement des fragments d'ADN marqués par fluorescence. Soixante-dix souches représentant 27 espèces de mycobactéries d'intérêt clinique ont été testées. Les séquences de toutes ces espèces ont été correctement identifiées. Parmi les souches de Mycobacterium tuberculosis, 15 souches résistantes à l'antibiotique rifampicine ont été reconnues. Ces travaux devraient aboutir à la commercialisation par Biomérieux d'un système de diagnostic automatisé dans le domaine de la bactériologie infectieuse. A partir de la Gene Chip, Biomérieux travaille aussi sur le génotypage des souches du VIH résistantes aux thérapies antirétrovirales, et celui d'agents microbiens de contamination en alimentaire et dans l'industrie des cosmétiques.

M. L. T.

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