Nous suivre Industrie Techno

Accélérer les recherches en biotechnologies

Industrie et  Technologies

Sujets relatifs :

, ,
Bioinformatics Toolbox 3.0 de The MathWorks


The MathWorks annonce une nouvelle version de l'outil Bioinformatics Toolbox pour Matlab. Celle-ci est destinée aux bioinformaticiens et aux chercheurs scientifiques pour l'exploration des idées, le prototypage de nouveaux algorithmes et la construction d'applications dans les domaines de la recherche de médicaments, de l'ingénierie génétique et d'autres projets génomiques et protéomiques.

Parmi les nouveautés de la Bioinformatics Toolbox 3.0 : les fonctionnalités pour l'analyse et la visualisation améliorées des données de biopuces ou des données de spectrométrie de masse, permettant ainsi d'accélérer le processus de recherche et de découverte. Les utilisateurs peuvent désormais procéder à des analyses plus précises de différentes formes de données de biopuces dont les biopuces CGH (hybridation génomique comparative sur puces), "tiling", SNP et les tableaux d'expression de gènes.



Les améliorations de Bioinformatics Toolbox donnent aux utilisateurs la possibilité de normaliser et de nettoyer les données de biopuces, de calculer l'expression de gènes, ou encore d'effectuer une segmentation binaire circulaire et l'estimation du taux de fausses découvertes. La Bioinformatics Toolbox 3.0 intègre des outils de visualisation permettant aux utilisateurs de tracer des idéogrammes chromosomiques en bande G.

La boîte à outils inclut une nouvelle fonctionnalité pour l'analyse des données de spectrométrie de masse, qui permet l'alignement des spectres de masse de plusieurs listes de pics provenant de jeux de données LC/MS ou GC/MS. The MathWorks propose également des améliorations dans d'autres domaines tels que la théorie des graphes et l'analyse de séquence.

Les chercheurs peuvent exploiter ces fonctionnalités de visualisation de pointe pour déterminer et afficher les chemins les plus courts dans des graphes, tester les cycles dans un graphe orienté ou identifier un isomorphisme entre deux graphes. Les nouvelles possibilités d'analyse de séquence procurent des outils permettant d'estimer et de visualiser les diagrammes de structure secondaire d'une séquence ARN.

Michel Le Toullec

Pour en savoir plus : http://www.mathworks.com

Bienvenue !

Vous êtes désormais inscrits. Vous recevrez prochainement notre newsletter hebdomadaire Industrie & Technologies

Nous vous recommandons

« Avec l’ADN, l’ensemble des données mondiales pourraient être stockées dans le volume d’une camionnette », clame François Képès, membre de l’Académie des Technologies

« Avec l’ADN, l’ensemble des données mondiales pourraient être stockées dans le volume d’une camionnette », clame François Képès, membre de l’Académie des Technologies

Les besoins de l'humanité pour le stockage de données s'accélèrent depuis quelques années, au point que les[…]

Ils mettent des neurones en cages

Ils mettent des neurones en cages

[En images] Plongée dans le labo de DNA Script, la start-up française de synthèse enzymatique de l'ADN mise en lumière par le Covid-19

[En images] Plongée dans le labo de DNA Script, la start-up française de synthèse enzymatique de l'ADN mise en lumière par le Covid-19

De l’hydrogène produit par photosynthèse in vivo

De l’hydrogène produit par photosynthèse in vivo

Plus d'articles